Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB30Q15771 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB30Q15771 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
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