Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNHIT3Q15649 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNHIT3Q15649 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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