Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT31Q15323 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT31Q15323 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms