Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFIXQ14938 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NFIXQ14938 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NFIXQ14938 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFIXQ14938 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFIXQ14938 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFIXQ14938 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFIXQ14938 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFIXQ14938 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NFIXQ14938 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFIXQ14938 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NFIXQ14938 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFIXQ14938 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
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