Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD9Q14511 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD9Q14511 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
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