Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SCARF1Q14162 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
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