Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGLL4Q14135 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGLL4Q14135 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VGLL4Q14135 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VGLL4Q14135 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VGLL4Q14135 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VGLL4Q14135 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
VGLL4Q14135 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VGLL4Q14135 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VGLL4Q14135 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VGLL4Q14135 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
VGLL4Q14135 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VGLL4Q14135 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VGLL4Q14135 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VGLL4Q14135 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VGLL4Q14135 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VGLL4Q14135 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VGLL4Q14135 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VGLL4Q14135 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VGLL4Q14135 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VGLL4Q14135 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VGLL4Q14135 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
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