Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB33AQ14088 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB33AQ14088 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB33AQ14088 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB33AQ14088 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB33AQ14088 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB33AQ14088 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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