Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A6Q14031 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms