Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBA3CQ13748 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3CQ13748 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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