Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
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