Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGA7Q13683 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA7Q13683 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.5 ms