Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FHL3Q13643 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FHL3Q13643 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms