Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPP1R1AQ13522 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R1AQ13522 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
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