Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNTA1Q13424 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNTA1Q13424 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNTA1Q13424 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNTA1Q13424 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNTA1Q13424 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SNTA1Q13424 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNTA1Q13424 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNTA1Q13424 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNTA1Q13424 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNTA1Q13424 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNTA1Q13424 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNTA1Q13424 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNTA1Q13424 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNTA1Q13424 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNTA1Q13424 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNTA1Q13424 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNTA1Q13424 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNTA1Q13424 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNTA1Q13424 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNTA1Q13424 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNTA1Q13424 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNTA1Q13424 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNTA1Q13424 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNTA1Q13424 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNTA1Q13424 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNTA1Q13424 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNTA1Q13424 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SNTA1Q13424 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNTA1Q13424 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNTA1Q13424 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNTA1Q13424 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNTA1Q13424 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNTA1Q13424 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNTA1Q13424 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNTA1Q13424 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNTA1Q13424 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNTA1Q13424 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNTA1Q13424 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNTA1Q13424 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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SNTA1Q13424 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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SNTA1Q13424 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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SNTA1Q13424 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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SNTA1Q13424 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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SNTA1Q13424 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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SNTA1Q13424 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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SNTA1Q13424 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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