Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB3BPQ13352 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
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