Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLF1Q13351 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms