Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENBP1Q13228 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENBP1Q13228 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms