Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI1Q12951 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms