Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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