Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFSWAPQ12872 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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