Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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RAB40BQ12829 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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RAB40BQ12829 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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RAB40BQ12829 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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RAB40BQ12829 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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RAB40BQ12829 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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RAB40BQ12829 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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RAB40BQ12829 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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RAB40BQ12829 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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RAB40BQ12829 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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RAB40BQ12829 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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