Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.84□□□□□ -1.47
RIM20Q12033 OCA1YNL099C 717 nt5.84□□□□□ -1.47
RIM20Q12033 HXT4YHR092C 1731 nt5.84□□□□□ -1.47
RIM20Q12033 PTR2YKR093W 1806 nt5.83□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 HXT14YNL318C 1623 nt5.83□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 ADE3YGR204W 2841 nt5.83□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 UTP9YHR196W 1728 nt5.82□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 TRS23YDR246W 660 nt5.82□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 MET31YPL038W 534 nt5.82□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 CAM1YPL048W 1248 nt5.82□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 ACC1YNR016C 6702 nt5.81□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 PUS6YGR169C 1215 nt5.81□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 SIR2YDL042C 1689 nt5.8□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 PRS1YKL181W 1284 nt5.8□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 MDG1YNL173C 1101 nt5.8□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 MKC7YDR144C 1791 nt5.8□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 MCH4YOL119C 1506 nt5.79□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 RSC6YCR052W 1452 nt5.79□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 MMT2YPL224C 1455 nt5.79□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 SED4YCR067C 3198 nt5.79□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 SLC1YDL052C 912 nt5.79□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 SRG1SRG1 551 nt5.79□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt5.79□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 YMR245WYMR245W 621 nt5.79□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 TUB2YFL037W 1374 nt5.79□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 UGA2YBR006W 1494 nt5.78□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 UGA1YGR019W 1416 nt5.78□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 PNP1YLR209C 936 nt5.78□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 YLR296WYLR296W 327 nt5.78□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 MED4YOR174W 855 nt5.78□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 CLB4YLR210W 1383 nt5.78□□□□□ -1.48
RIM20Q12033 YEF1YEL041W 1488 nt5.77□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 ROT2YBR229C 2865 nt5.77□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 MRF1YGL143C 1242 nt5.77□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 KRE9YJL174W 831 nt5.77□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 YJL193WYJL193W 1209 nt5.77□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 GEP5YLR091W 882 nt5.77□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 CUE5YOR042W 1236 nt5.77□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 SLX5YDL013W 1860 nt5.77□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 YIR007WYIR007W 2295 nt5.76□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 YJL171CYJL171C 1191 nt5.76□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 TLG2YOL018C 1194 nt5.76□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 ZPS1YOL154W 750 nt5.76□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 MGS1YNL218W 1764 nt5.75□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 SER33YIL074C 1410 nt5.75□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 COX17YLL009C 210 nt5.75□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 RFA2YNL312W 822 nt5.75□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 CKB2YOR039W 777 nt5.75□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 YNG2YHR090C 849 nt5.74□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 APN1YKL114C 1104 nt5.74□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 HEM15YOR176W 1182 nt5.74□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 QCR2YPR191W 1107 nt5.74□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 PDB1YBR221C 1101 nt5.74□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 RPN5YDL147W 1338 nt5.74□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 YDR417CYDR417C 372 nt5.73□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 TRX2YGR209C 315 nt5.73□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.73□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 PEX32YBR168W 1242 nt5.73□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 UBX2YML013W 1755 nt5.72□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 MHF2YDL160C-A 243 nt5.72□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 AAD4YDL243C 990 nt5.72□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 RPL28YGL103W 450 nt5.72□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.72□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.72□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 YNL108CYNL108C 813 nt5.72□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 SFT2YBL102W 648 nt5.72□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 DCI1YOR180C 816 nt5.72□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 SCP1YOR367W 603 nt5.72□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 DRN1YGR093W 1524 nt5.72□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 RGT1YKL038W 3513 nt5.72□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 URA7YBL039C 1740 nt5.71□□□□□ -1.49
RIM20Q12033 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.71□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.71□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 UPS3YDR185C 540 nt5.71□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 YGR291CYGR291C 222 nt5.71□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 RSA3YLR221C 663 nt5.71□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 SEC17YBL050W 879 nt5.71□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt5.71□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 VID30YGL227W 2877 nt5.71□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 YJR124CYJR124C 1347 nt5.71□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 YAP1802YGR241C 1707 nt5.71□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 ELP2YGR200C 2367 nt5.7□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 RTT103YDR289C 1230 nt5.7□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 YER187WYER187W 426 nt5.7□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 DBP8YHR169W 1296 nt5.7□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 PEX22YAL055W 543 nt5.7□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 YNL174WYNL174W 573 nt5.7□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 TRM10YOL093W 882 nt5.7□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 TRS33YOR115C 807 nt5.7□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 NHP6AYPR052C 282 nt5.7□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 HOS2YGL194C 1359 nt5.69□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 YLH47YPR125W 1365 nt5.69□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 YMR102CYMR102C 2505 nt5.69□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 DUG1YFR044C 1446 nt5.69□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 YDL121CYDL121C 450 nt5.69□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 AVO1YOL078W 3531 nt5.69□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 UBX7YBR273C 1311 nt5.69□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 FAP1YNL023C 2898 nt5.68□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 NOP16YER002W 696 nt5.68□□□□□ -1.5
RIM20Q12033 ARO2YGL148W 1131 nt5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.4 ms