Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CPSF1Q10570 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
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