Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 879.5 ms