Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ZNF543Q08ER8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms