Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSC1Q08554 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms