Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDR1Q08345 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDR1Q08345 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms