Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNK2Q07912 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms