Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CHRNDQ07001 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms