Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSTF1Q05048 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms