Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPEQ02224 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms