Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SATB1Q01826 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms