Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK3Q00526 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms