Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CRB1P82279 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CRB1P82279 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CRB1P82279 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CRB1P82279 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CRB1P82279 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CRB1P82279 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CRB1P82279 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CRB1P82279 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CRB1P82279 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CRB1P82279 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CRB1P82279 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CRB1P82279 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CRB1P82279 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CRB1P82279 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CRB1P82279 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CRB1P82279 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CRB1P82279 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CRB1P82279 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CRB1P82279 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CRB1P82279 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CRB1P82279 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CRB1P82279 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
CRB1P82279 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CRB1P82279 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CRB1P82279 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CRB1P82279 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CRB1P82279 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CRB1P82279 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CRB1P82279 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CRB1P82279 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CRB1P82279 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CRB1P82279 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CRB1P82279 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CRB1P82279 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CRB1P82279 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
CRB1P82279 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC31.07■■■□□ 2.57
CRB1P82279 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
CRB1P82279 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CRB1P82279 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CRB1P82279 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CRB1P82279 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CRB1P82279 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CRB1P82279 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CRB1P82279 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CRB1P82279 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CRB1P82279 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CRB1P82279 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CRB1P82279 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CRB1P82279 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CRB1P82279 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CRB1P82279 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CRB1P82279 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CRB1P82279 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CRB1P82279 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CRB1P82279 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CRB1P82279 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CRB1P82279 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CRB1P82279 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CRB1P82279 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CRB1P82279 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CRB1P82279 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CRB1P82279 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CRB1P82279 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CRB1P82279 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CRB1P82279 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CRB1P82279 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CRB1P82279 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CRB1P82279 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CRB1P82279 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CRB1P82279 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CRB1P82279 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CRB1P82279 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CRB1P82279 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CRB1P82279 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CRB1P82279 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CRB1P82279 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CRB1P82279 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CRB1P82279 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CRB1P82279 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CRB1P82279 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CRB1P82279 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CRB1P82279 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CRB1P82279 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CRB1P82279 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CRB1P82279 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CRB1P82279 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CRB1P82279 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CRB1P82279 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CRB1P82279 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CRB1P82279 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CRB1P82279 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CRB1P82279 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CRB1P82279 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CRB1P82279 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CRB1P82279 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CRB1P82279 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CRB1P82279 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CRB1P82279 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CRB1P82279 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms