Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL7P80098 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL7P80098 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL7P80098 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL7P80098 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL7P80098 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL7P80098 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL7P80098 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL7P80098 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL7P80098 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL7P80098 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL7P80098 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL7P80098 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL7P80098 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL7P80098 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL7P80098 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL7P80098 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL7P80098 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL7P80098 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL7P80098 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL7P80098 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL7P80098 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL7P80098 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL7P80098 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL7P80098 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL7P80098 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL7P80098 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL7P80098 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL7P80098 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL7P80098 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL7P80098 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL7P80098 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL7P80098 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL7P80098 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL7P80098 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL7P80098 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL7P80098 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL7P80098 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL7P80098 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL7P80098 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL7P80098 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL7P80098 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL7P80098 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL7P80098 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL7P80098 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL7P80098 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL7P80098 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL7P80098 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL7P80098 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL7P80098 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL7P80098 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL7P80098 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL7P80098 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL7P80098 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL7P80098 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL7P80098 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL7P80098 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL7P80098 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL7P80098 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL7P80098 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL7P80098 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL7P80098 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL7P80098 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL7P80098 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL7P80098 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL7P80098 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL7P80098 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL7P80098 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL7P80098 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL7P80098 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL7P80098 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL7P80098 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL7P80098 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL7P80098 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL7P80098 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL7P80098 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL7P80098 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL7P80098 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL7P80098 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL7P80098 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL7P80098 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL7P80098 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL7P80098 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL7P80098 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL7P80098 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL7P80098 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL7P80098 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL7P80098 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL7P80098 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL7P80098 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL7P80098 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL7P80098 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL7P80098 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL7P80098 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL7P80098 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL7P80098 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL7P80098 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL7P80098 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL7P80098 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL7P80098 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms