Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBB4BP68371 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms