Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2IP63279 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms