Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms