Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P63132 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P63132 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P63132 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P63132 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P63132 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P63132 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P63132 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P63132 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P63132 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms