Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMO4P61968 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMO4P61968 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMO4P61968 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMO4P61968 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LMO4P61968 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMO4P61968 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMO4P61968 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMO4P61968 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMO4P61968 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMO4P61968 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMO4P61968 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMO4P61968 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMO4P61968 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMO4P61968 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMO4P61968 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LMO4P61968 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LMO4P61968 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO4P61968 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO4P61968 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO4P61968 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO4P61968 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO4P61968 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO4P61968 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO4P61968 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO4P61968 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO4P61968 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO4P61968 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO4P61968 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO4P61968 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO4P61968 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO4P61968 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO4P61968 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO4P61968 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO4P61968 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO4P61968 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO4P61968 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO4P61968 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO4P61968 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO4P61968 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO4P61968 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO4P61968 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO4P61968 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO4P61968 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO4P61968 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO4P61968 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO4P61968 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO4P61968 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO4P61968 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO4P61968 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO4P61968 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO4P61968 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO4P61968 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO4P61968 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO4P61968 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO4P61968 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO4P61968 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO4P61968 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO4P61968 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO4P61968 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO4P61968 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO4P61968 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO4P61968 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO4P61968 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO4P61968 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO4P61968 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO4P61968 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO4P61968 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO4P61968 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO4P61968 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO4P61968 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO4P61968 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO4P61968 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO4P61968 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO4P61968 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO4P61968 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LMO4P61968 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO4P61968 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO4P61968 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO4P61968 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO4P61968 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO4P61968 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO4P61968 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO4P61968 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO4P61968 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO4P61968 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO4P61968 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO4P61968 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO4P61968 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO4P61968 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO4P61968 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO4P61968 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO4P61968 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO4P61968 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO4P61968 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO4P61968 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO4P61968 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO4P61968 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO4P61968 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO4P61968 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms