Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCDC1P59894 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms