Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CABP4P57796 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CABP4P57796 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CABP4P57796 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CABP4P57796 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CABP4P57796 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CABP4P57796 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CABP4P57796 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CABP4P57796 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CABP4P57796 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CABP4P57796 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CABP4P57796 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CABP4P57796 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CABP4P57796 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CABP4P57796 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CABP4P57796 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CABP4P57796 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CABP4P57796 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CABP4P57796 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CABP4P57796 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CABP4P57796 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CABP4P57796 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CABP4P57796 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CABP4P57796 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CABP4P57796 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CABP4P57796 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CABP4P57796 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CABP4P57796 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CABP4P57796 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CABP4P57796 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CABP4P57796 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CABP4P57796 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CABP4P57796 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CABP4P57796 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CABP4P57796 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CABP4P57796 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CABP4P57796 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CABP4P57796 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CABP4P57796 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CABP4P57796 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CABP4P57796 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CABP4P57796 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CABP4P57796 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CABP4P57796 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CABP4P57796 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CABP4P57796 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CABP4P57796 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CABP4P57796 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CABP4P57796 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CABP4P57796 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CABP4P57796 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CABP4P57796 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CABP4P57796 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CABP4P57796 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CABP4P57796 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CABP4P57796 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CABP4P57796 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CABP4P57796 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CABP4P57796 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CABP4P57796 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CABP4P57796 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CABP4P57796 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CABP4P57796 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CABP4P57796 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CABP4P57796 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CABP4P57796 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CABP4P57796 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CABP4P57796 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CABP4P57796 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CABP4P57796 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CABP4P57796 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CABP4P57796 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CABP4P57796 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CABP4P57796 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CABP4P57796 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CABP4P57796 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CABP4P57796 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CABP4P57796 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CABP4P57796 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CABP4P57796 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CABP4P57796 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CABP4P57796 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CABP4P57796 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CABP4P57796 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CABP4P57796 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CABP4P57796 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CABP4P57796 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CABP4P57796 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CABP4P57796 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CABP4P57796 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CABP4P57796 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CABP4P57796 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CABP4P57796 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CABP4P57796 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CABP4P57796 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CABP4P57796 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CABP4P57796 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CABP4P57796 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CABP4P57796 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CABP4P57796 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms