Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRG3P56975 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRG3P56975 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRG3P56975 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRG3P56975 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRG3P56975 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRG3P56975 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRG3P56975 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRG3P56975 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRG3P56975 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NRG3P56975 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRG3P56975 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRG3P56975 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRG3P56975 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRG3P56975 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRG3P56975 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRG3P56975 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRG3P56975 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRG3P56975 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRG3P56975 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NRG3P56975 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRG3P56975 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRG3P56975 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRG3P56975 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRG3P56975 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NRG3P56975 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRG3P56975 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRG3P56975 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRG3P56975 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRG3P56975 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRG3P56975 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRG3P56975 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRG3P56975 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRG3P56975 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRG3P56975 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRG3P56975 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRG3P56975 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRG3P56975 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRG3P56975 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRG3P56975 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRG3P56975 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRG3P56975 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRG3P56975 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRG3P56975 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NRG3P56975 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRG3P56975 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NRG3P56975 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRG3P56975 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRG3P56975 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRG3P56975 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRG3P56975 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRG3P56975 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRG3P56975 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRG3P56975 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRG3P56975 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRG3P56975 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRG3P56975 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NRG3P56975 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRG3P56975 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRG3P56975 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRG3P56975 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRG3P56975 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRG3P56975 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRG3P56975 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NRG3P56975 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRG3P56975 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRG3P56975 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRG3P56975 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRG3P56975 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRG3P56975 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRG3P56975 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRG3P56975 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRG3P56975 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRG3P56975 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRG3P56975 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRG3P56975 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NRG3P56975 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRG3P56975 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRG3P56975 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRG3P56975 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRG3P56975 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRG3P56975 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRG3P56975 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRG3P56975 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRG3P56975 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRG3P56975 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NRG3P56975 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRG3P56975 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NRG3P56975 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRG3P56975 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRG3P56975 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRG3P56975 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRG3P56975 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRG3P56975 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRG3P56975 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRG3P56975 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRG3P56975 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRG3P56975 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRG3P56975 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRG3P56975 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms