Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP1P56182 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP1P56182 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP1P56182 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP1P56182 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP1P56182 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP1P56182 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP1P56182 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP1P56182 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP1P56182 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP1P56182 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP1P56182 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP1P56182 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP1P56182 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP1P56182 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP1P56182 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP1P56182 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP1P56182 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP1P56182 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRP1P56182 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRP1P56182 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRP1P56182 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRP1P56182 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRP1P56182 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRP1P56182 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP1P56182 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP1P56182 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP1P56182 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP1P56182 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP1P56182 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP1P56182 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP1P56182 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP1P56182 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP1P56182 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRP1P56182 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRP1P56182 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRP1P56182 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRP1P56182 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRP1P56182 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP1P56182 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP1P56182 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP1P56182 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP1P56182 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP1P56182 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP1P56182 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP1P56182 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP1P56182 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP1P56182 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP1P56182 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RRP1P56182 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RRP1P56182 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
RRP1P56182 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RRP1P56182 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RRP1P56182 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RRP1P56182 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RRP1P56182 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RRP1P56182 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RRP1P56182 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP1P56182 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP1P56182 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP1P56182 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP1P56182 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP1P56182 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP1P56182 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP1P56182 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP1P56182 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRP1P56182 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRP1P56182 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRP1P56182 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRP1P56182 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRP1P56182 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRP1P56182 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRP1P56182 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRP1P56182 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRP1P56182 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RRP1P56182 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RRP1P56182 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RRP1P56182 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RRP1P56182 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RRP1P56182 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RRP1P56182 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRP1P56182 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRP1P56182 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRP1P56182 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRP1P56182 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRP1P56182 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRP1P56182 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRP1P56182 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RRP1P56182 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RRP1P56182 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RRP1P56182 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RRP1P56182 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RRP1P56182 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RRP1P56182 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RRP1P56182 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RRP1P56182 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RRP1P56182 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RRP1P56182 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRP1P56182 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRP1P56182 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms