Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX9P55771 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX9P55771 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX9P55771 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX9P55771 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX9P55771 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX9P55771 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX9P55771 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX9P55771 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX9P55771 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX9P55771 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX9P55771 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX9P55771 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX9P55771 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX9P55771 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX9P55771 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX9P55771 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX9P55771 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX9P55771 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX9P55771 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX9P55771 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX9P55771 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX9P55771 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX9P55771 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX9P55771 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX9P55771 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX9P55771 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX9P55771 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX9P55771 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX9P55771 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX9P55771 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX9P55771 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX9P55771 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX9P55771 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX9P55771 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX9P55771 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX9P55771 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX9P55771 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX9P55771 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX9P55771 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX9P55771 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX9P55771 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX9P55771 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX9P55771 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX9P55771 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX9P55771 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX9P55771 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX9P55771 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX9P55771 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX9P55771 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX9P55771 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX9P55771 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX9P55771 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX9P55771 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX9P55771 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX9P55771 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX9P55771 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX9P55771 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX9P55771 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX9P55771 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX9P55771 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX9P55771 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX9P55771 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX9P55771 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX9P55771 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX9P55771 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX9P55771 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX9P55771 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAX9P55771 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAX9P55771 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PAX9P55771 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX9P55771 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX9P55771 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX9P55771 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX9P55771 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX9P55771 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX9P55771 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX9P55771 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX9P55771 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX9P55771 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX9P55771 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX9P55771 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX9P55771 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX9P55771 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX9P55771 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX9P55771 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX9P55771 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX9P55771 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX9P55771 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX9P55771 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX9P55771 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX9P55771 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX9P55771 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX9P55771 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX9P55771 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX9P55771 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX9P55771 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX9P55771 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX9P55771 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX9P55771 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms