Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH8P55286 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH8P55286 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH8P55286 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH8P55286 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH8P55286 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH8P55286 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH8P55286 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH8P55286 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH8P55286 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH8P55286 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH8P55286 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH8P55286 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH8P55286 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH8P55286 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH8P55286 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH8P55286 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH8P55286 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH8P55286 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH8P55286 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH8P55286 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH8P55286 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH8P55286 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH8P55286 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH8P55286 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH8P55286 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH8P55286 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH8P55286 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH8P55286 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH8P55286 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH8P55286 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH8P55286 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH8P55286 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDH8P55286 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH8P55286 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH8P55286 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH8P55286 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH8P55286 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH8P55286 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH8P55286 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH8P55286 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH8P55286 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH8P55286 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH8P55286 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH8P55286 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH8P55286 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH8P55286 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH8P55286 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH8P55286 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH8P55286 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH8P55286 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH8P55286 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH8P55286 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH8P55286 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH8P55286 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH8P55286 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH8P55286 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH8P55286 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH8P55286 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH8P55286 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH8P55286 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH8P55286 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH8P55286 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH8P55286 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH8P55286 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH8P55286 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH8P55286 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH8P55286 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH8P55286 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH8P55286 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH8P55286 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH8P55286 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH8P55286 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH8P55286 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH8P55286 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH8P55286 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH8P55286 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH8P55286 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH8P55286 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH8P55286 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH8P55286 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH8P55286 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH8P55286 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH8P55286 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH8P55286 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH8P55286 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH8P55286 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH8P55286 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH8P55286 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH8P55286 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH8P55286 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH8P55286 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH8P55286 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH8P55286 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH8P55286 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH8P55286 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH8P55286 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH8P55286 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH8P55286 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH8P55286 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms