Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NAP1L1P55209 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NAP1L1P55209 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms