Protein–RNA interactions for Protein: P55083

MFAP4, Microfibril-associated glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP4P55083 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MFAP4P55083 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MFAP4P55083 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MFAP4P55083 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms