Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLTPP55058 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLTPP55058 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLTPP55058 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLTPP55058 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PLTPP55058 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLTPP55058 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLTPP55058 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLTPP55058 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLTPP55058 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLTPP55058 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLTPP55058 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLTPP55058 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLTPP55058 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLTPP55058 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLTPP55058 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLTPP55058 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLTPP55058 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLTPP55058 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLTPP55058 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLTPP55058 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLTPP55058 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLTPP55058 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLTPP55058 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLTPP55058 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLTPP55058 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLTPP55058 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLTPP55058 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLTPP55058 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLTPP55058 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
PLTPP55058 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLTPP55058 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLTPP55058 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLTPP55058 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLTPP55058 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLTPP55058 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLTPP55058 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLTPP55058 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLTPP55058 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLTPP55058 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLTPP55058 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLTPP55058 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLTPP55058 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLTPP55058 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLTPP55058 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLTPP55058 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLTPP55058 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLTPP55058 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLTPP55058 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLTPP55058 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLTPP55058 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLTPP55058 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLTPP55058 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLTPP55058 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLTPP55058 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLTPP55058 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLTPP55058 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLTPP55058 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLTPP55058 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLTPP55058 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLTPP55058 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLTPP55058 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLTPP55058 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLTPP55058 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLTPP55058 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLTPP55058 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLTPP55058 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLTPP55058 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLTPP55058 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLTPP55058 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLTPP55058 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLTPP55058 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLTPP55058 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLTPP55058 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLTPP55058 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLTPP55058 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLTPP55058 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLTPP55058 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PLTPP55058 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLTPP55058 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLTPP55058 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLTPP55058 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PLTPP55058 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLTPP55058 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLTPP55058 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PLTPP55058 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLTPP55058 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLTPP55058 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PLTPP55058 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLTPP55058 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLTPP55058 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLTPP55058 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLTPP55058 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLTPP55058 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLTPP55058 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLTPP55058 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLTPP55058 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLTPP55058 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLTPP55058 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PLTPP55058 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms